Восточно-Казахстанская археологическая экспедиция (ВКАЭ) (начальник – доктор исторических наук З. Самашев): Берелскийархеологический отряд (начальник – к.и.н. А. Онгар). Объект и период исследования: могильник Берел. Ранний железный век. Место проведения полевых работ: с. Берел, Катон-Карагайский район ВКО. Каракабинскийархеологический отряд (начальник – А. Чотбаев). Объект и период исследования: могильник Каракаба. Ранний железный век. Место проведения полевых работ: с. Енбек, Катон-Карагайский район ВКО. Тарбагатайскийархеологический отряд (начальник – Е. Оралбай). Объект и период исследования: могильник Аксуат. Ранний железный век. Место проведения полевых работ: с. Аксуат, Тарбагатайский район ВКО. СЕВЕРНЫЙ КАЗАХСТАН: Ботайскийархеологический отряд (начальник – доктор исторических наук В.Зайберт). Объект и период исследования: поселение Красный Яр. Энеолит. Место проведения полевых работ: район, Акмолинская область. Халвайскийархеологический отряд (начальник – А. Логвин). Объект и период исследования: могильник Халвай, Бронзовый век. Место проведения полевых работ: Тарановский район, Костанайская область. Аршалынскийархеологический отряд (начальник – к.и.н. Д. Байтлеу). Объект и период исследования: могильник Аршалы (Ижевский). Бронзовый век. Место проведения полевых работ: Аршалынский район, Акмолинская область.
В настоящее время для проведения полевых археологических изыскании в институте действуют следующие экспедиции
Восточно-Казахстанская археологическая экспедиция (ВКАЭ) (начальник – З. Самашев):
Берелский археологический отряд (начальник – А. Онгар)
объект и период исследования: могильник Берел место проведения полевых работ: с. Берел, Катон-Карагайский район ВКО
Каракабинский археологический отряд (начальник – А. Чотбаев)
объект и период исследования: могильник Каракаба место проведения полевых работ: с. Енбек, Катон-Карагайский район ВКО
Тарбагатайский археологический отряд (начальник – Е. Оралбай)
объект и период исследования: могильник Аксуат место проведения полевых работ: с. Аксуат, Тарбагатайский район ВКО
СЕВЕРНЫЙ КАЗАХСТАН:
Ботайский археологический отряд (начальник – В.Зайберт)
объект и период исследования: поселение Красный Яр, эпохи энеолита место проведения полевых работ: район, Акмолинская область
Халвайский археологический отряд (начальник – А. Логвин)
объект и период исследования: могильник Халвай, эпохи бронзы место проведения полевых работ: Тарановский район, Костанайская область
Аршалынский археологический отряд (начальник – Д. Байтлеу)
объект и период исследования: могильник Аршалы (Ижевский), эпохи бронзы место проведения полевых работ: Аршалынский район, Акмолинская область
СЕМИРЕЧЬЕ И ЮЖНЫЙ КАЗАХСТАН:
Угамский археологический отряд (начальник – А.Подушкин)
объект и период исследования: Угамское ущелье, памятники эпохи палеолита – раннего железного века место проведения полевых работ: Толебийский район, Южно-Казахстанская область
объект и период исследования: погребально-поминальный комплекс Каркара, эпохи раннего железного века место проведения полевых работ: с. Каркара, Райымбекский район, Алматинская область
Катартобинский археологический отряд (начальник – А. Чотбаев)
объект и период исследования: могильник Катартобе, эпохи раннего железного века место проведения полевых работ: с. Шалкоде, Райымбекский район, Алматинская область
Устюртский археологический отряд (начальник – Т. Лошакова).
объект и период исследования: поселения Токсанбай, Айтман, Манайсор1-3, эпохи энеолита-неолита место проведения полевых работ: с. Турыш, Бейнеуский район, Мангистауская область
Мугалжарский археологический отряд (начальник – Д. Байтлеу).
объект и период исследования: горно-металлургический центр Мугалжар, эпохи бронзы место проведения полевых работ: Мугалжарский район, Актюбинская область
Петроглифический отряд (начальник – З. Самашев):
объект и период исследования: петроглифы Сауыскандык, эпохи бронзы место проведения полевых работ: Шиелинский район, Кызылординская область
СЕМИРЕЧЬЕ И ЮЖНЫЙ КАЗАХСТАН: Угамскийархеологический отряд (начальник – доктор исторических наук А.Подушкин). Объект и период исследования: Угамское ущелье. Палеолит – ранний железный век. Место проведения полевых работ: Толебийский район, ЮКО. Семиреченская археологическая экспедиция (САЭ) (начальник –А. Онгар): Каркаринскийархеологический отряд(начальник –А. Онгар). Объект и период исследования: погребально-поминальный комплекс Каркара. Ранний железный век. Место проведения полевых работ: с. Каркара, Райымбекский район, Алматинская область. Катартобинскийархеологический отряд (начальник – А. Чотбаев). Объект и период исследования: могильник Катартобе. Ранний железный век. Место проведения полевых работ: с. Шалкоде, Райымбекский район, Алматинская область. ЗАПАДНЫЙ КАЗАХСТАН: Западно-Казахстанская археологическая экспедиция (ЗКАЭ) (начальник –З. Самашев): Устюртскийархеологический отряд (начальник – Т. Лошакова). Объект и период исследования: поселения Токсанбай, Айтман, Манайсор 1-3, Энеолит-неолит. Место проведения полевых работ: с. Турыш, Бейнеуский район, Мангистауская область Мугалжарскийархеологический отряд (начальник – Д. Байтлеу). объект и период исследования: горно-металлургический центр Мугалжар, Бронзовый век. место проведения полевых работ: Мугалжарский район, Актюбинская область. Петроглифический отряд (начальник – З. Самашев): Объект и период исследования: петроглифыСауыскандык, Тарбагатай, Толеубулак и др.